马诺沃·贡达·圣弗罗里斯国家公园海拔在400-800米之间，由3个地形带组成。公园里的低地每年都会季节性地遭洪水淹没。尽管低地的排水能力十分薄弱，但却形成了一层深厚的优质冲积土壤。平原上的土壤通常是易干燥的劣等赤褐色土，在其中一些地方，尤其是洼地进而发展成铁矾土或铁矿石层，这些地区树木稀少，甚至可以算得上是不毛之地。山岳与平原以悬崖相隔，它主要是有砂岩构成的，沟壑众多。五条大河的干流从山上奔流而下，滋润着公园的土地。但到每个干旱季节的尾期，河水大都会断流。该公园属热带半湿润气候，每年平均降水量在950-1700毫米之间，降雨季节多分布在6月-11月。比较起来，高地降水略为丰富，而北部的平原地区温度较高。
马诺沃·贡达·圣弗罗里斯国家公园的植被以热带稀树大草原为主，后者又可进一步划分为五种类型。与风车子属植物一起点缀着草原的是“铁矿石草地”，这些铁矿石贴近地表，仿佛是为我们展现大自然中土壤和地形的镶嵌艺术。到了干旱期，长着榄仁树的广阔草原便成了像大象这样的大型哺乳动物的避难场所。洪水泛滥最为严重的地区一般生长着多年生草本植物、莎草及一年生非禾本草本植物，而木本植物和灌木丛只好零星地点缀在地势较高的地方。南部地区的山上生长着青翠的竹林，河水发源地附近也分布着一些林地。
迄今为止，科学家们对马诺沃·贡达·圣弗罗里斯国家公园的动物进行了很多研究，但目前的报道主要集中于包括圣弗罗里斯及其附近的公园北部地区的情况。在这些地区发现了几种世界珍稀保护动物：黑色犀牛（据报道，目前已不足10头）；非洲大象（大约在2000-3000头之间）；豹；印度豹（一种似豹动物，产于南亚及非洲）、豺狗、鲸头鹳以及湾鳄。不幸的是，过去造成豹和鳄鱼岌岌可危的“偷猎”，又将魔爪伸向了濒临灭绝的犀牛和大象。据悉，公园的南部边界处还发现了瞪羚的踪迹。圣弗罗里斯地区最常见的大型哺乳动物应该是非洲水羚，除此之外还有9种有蹄类动物，例如小羚羊、侏羚、转角牛羚、小苇羚、河马、疣猪和非洲水牛等。据记载，公园中最常见的灵长类动物是狒狒，在干燥森林里还发现了少量疣猴。其它著名的哺乳动物有杂色弯角羚、狮子、长颈鹿和一些公园里确实存在但比较鲜见的动物，如金猫和黄背小羚羊。对于喜夜间出没的动物，人们的研究不多，但普遍认为薮猫和少量夜猴夜间活动频繁。自1980年以来，公园里还陆续发现了大河猪、长尾猴、白鼻猴和蹄兔。马诺沃－贡达－圣弗罗里斯国家公园目前可以确认的鸟类达320多种，其中至少有25种属于猛禽，例如非洲鱼鹰。每年来这栖息的候鸟宛如皓海繁星，数不胜数。
这个场所被列入世界濒危遗产目录是根据对违法放牧和用重型武器偷猎行为的报告， 据一些报告称这些人已经猎杀了公园里百分之八十的野生动物。安全状况不断恶化，1997年初还有四个公园工作人员被杀死， 导致发展项目和旅游观光业被迫中断。