东华派是从灵宝派分化出来的一个新道派，创始人是南宋初的宁全真。宁全真（1101——1181年），字本立，开封人。曾从田思真和仙人任子光受教，得东华、灵宝二派之传，遂将二系教法合而为一。从此道业大进，以斋醮祈祷之术行化南方。绍兴二十八年（1158年），金国南侵，高宗特旨召全真入殿廷，命奏章于天地，祈求国家平安。事毕，赐号“清微高士”，封“赞化先生”。以后国家每有斋醮之事，常命全真主典。晚年居浙江何淳真家，讲授道法，所传弟子甚多。宁全真所创的东华派，在上清、灵宝派传统的存思神真的基础上，吸收了内丹丹法，重视行法者个人的内炼工夫，把静坐修炼视为彻视通神、斋醮炼度之本。东华派传至元代林灵真时，又进入了一个兴盛时期。林灵真（1239——1302年），原名伟夫，字君昭，温州人。累举不第，乃弃儒从道，舍宅为观。从林虚一、薛熙真学东华道法。三十八代天师命其为温州路玄学讲师，不久升任本州道录。主持温州天清观，受教弟子百余人，龙虎山天师道弟子董处谦和后任玄教大宗师的吴全节，皆曾受其学。
　　在元统一全国之后，天师道在北方得到迅速传播，全真道在南方有较大发展。其他力量较为薄弱的各道派则逐渐与天师道或全真道相融合，符箓各派（如茅山宗、阁皂宗等）融入天师道（龙虎宗）之后，统称为正一道，从而形成正一和全真两大道派。经元、明、清各代，流传至今。
　　宗元之际，正一道与元朝皇室关系密切，因而在元代颇受尊崇，愈加兴盛。据说早在灭南宗之先，元世祖便于1259年派密使潜入龙虎山，访问35代天师张可大，向他不问统一天下之事。张可大回答说：“后二十年天下当混一。”南宗灭亡后，忽必烈乃于至元十三（1276）召见张可大之子，第36代天师张宗演，赐以玉芙蓉冠，组金无缝服，命他主领江南诸路道教，赐给银印。次年又封张为真人，命于长春宫主持周天大醮。从此之后，元朝历代师嗣位，皆沿例赐为真人，袭掌三山符箓及江南诸路道教，有权荐举任免江南各地的道录与宫观提点，奏请新建宫观名额及度牒，并可“自出牒度人为道士”。元代天师中最荣耀者为第38代天师张与材，他因劾治潮患有功，于成宗大德八年（1304）被封为“正一教主”，武宗即位后又授金紫光禄大夫，封留国公，赐给金印，秩视一品。第39代天师张嗣成，于泰定二年（1325）被封为“翊元崇德正一教主”并授集贤院知事，掌管天下道教事务。
　　元代正一道士中还出现了荣耀超过天师的张留孙、吴全节师徒。张留孙（1248——1321）原是张宗演弟子，至元十三年随师入朝，对答称旨，遂留侍阙下。元祖常向他询问修身治国之道，又曾为皇太子、皇后请祷治病有验，因而得到宠信，被封为上卿，赐给宝剑，并敕命两京各建崇真宫，让张留孙居之以掌祀事。至元二十五年（1278），又加封他为“玄教宗师、道教都提点、管领江北淮西荆襄道教事”，佩银印。此后元世祖对张“宠遇日隆，比于亲臣”。或命其出祠名山大川，或奉旨去江南访求遗贤，又受命为武宗、仁宗取名，参与任命宰相的决策等等。后来元成宗、武宗、仁宗等朝，对张的宠信亦始终不衰，“朝廷有大谋议，必见咨问”。他被加封的头衔愈来愈显耀，官阶也从三品进至一品。元成宗时被封为“玄教大宗师同知事集贤院道教事”，追赠三代魏国公。元武宗加封“大真人知集贤院大学士”。仁宗又加封为：“开府仪同三司、特进上卿、辅成赞化保运玄教大宗师、志道弘教冲玄仁靖大真人、知集贤院事、领诸路道教事。”其封号长达43字，可谓显赫无比。至治元年张留孙去世，又被元英宗封赠“真君”之号。其门下高徒有75人，其中封真人并分掌各地道教提点者7人，另有9人被命为宫观提点。
　　张留孙大弟子吴全节（1240——1321），出身儒门，随其师至大都。大德十一年（1370）被授为“玄教嗣师”。至治三年（1322）继承师位，出任玄教大宗师，赐真号，总摄江淮荆襄等处道教。他掌教25年，好与儒士结交。曾于至顺二年（1331）进陆九渊《语录》于朝，使陆氏心学为元室所重视，又曾荐举吴洽澄、阎复等儒臣。他去世后，夏文泳、张德隆、于有兴等人相继出掌玄教宗师。直至元朝灭亡后，明太祖只承认张天师后嗣，而不承认玄教宗师，张留孙的玄教法嗣遂告终结。
　　正一道不出家，多从事符箓斋醮，祈福禳灾；全真道主张“全神炼气，出家修真”，建立了传戒和丛林制度。